科学家绘制出肺腺癌中免疫细胞的空间位置图谱
来源：中检健康
编辑：中检健康
时间：2020-05-30
英国癌症研究所Yinyin Yuan、伦敦大学学院Charles Swanton、剑桥大学John Le Quesne等研究人员合作绘制了肺腺癌中免疫细胞的空间位置图谱。这一研究成果于2020年5月27日在线发表在《自然—医学》上。
研究人员将多区域外显子组和RNA测序（RNA-seq）数据与空间组织学信息进行了整合。这些空间组织学信息通过深度学习在TRACERx队列中的100例非小细胞肺癌患者中产生。来自免疫冷区的癌症亚克隆在突变空间中的相关性更高，比来自免疫热区的亚克隆更多样化。在TRACERx和970例肺腺癌的独立多样本队列中，超过一个免疫冷区的肿瘤复发风险更高，与肿瘤大小、分期和样本数无关。
在肺腺癌中（而不是肺鳞状细胞癌），在不破坏抗原呈递的情况下，肿瘤区域中癌-基质细胞界面的几何不规则性和复杂性显著增加。在具有低克隆新抗原负担的肿瘤中观察到相邻基质中淋巴细胞积累的减少。总的来说，免疫空间位置变异性阐明了肿瘤生态学中的限制因素，这些因素可能会影响免疫逃避的亚克隆和侵袭性临床表型的出现。
据了解，分子分析方面的显著进展提高人们对癌细胞免疫逃逸进化的理解。然而，尚未阐明免疫和基质细胞的空间构象，这可能揭示免疫逃逸在肿瘤空间位置的进化。
文章来源：https://www.nature.com/articles/s41591-020-0900-x
作者：科学网 小柯机器人
研究人员将多区域外显子组和RNA测序（RNA-seq）数据与空间组织学信息进行了整合。这些空间组织学信息通过深度学习在TRACERx队列中的100例非小细胞肺癌患者中产生。来自免疫冷区的癌症亚克隆在突变空间中的相关性更高，比来自免疫热区的亚克隆更多样化。在TRACERx和970例肺腺癌的独立多样本队列中，超过一个免疫冷区的肿瘤复发风险更高，与肿瘤大小、分期和样本数无关。
在肺腺癌中（而不是肺鳞状细胞癌），在不破坏抗原呈递的情况下，肿瘤区域中癌-基质细胞界面的几何不规则性和复杂性显著增加。在具有低克隆新抗原负担的肿瘤中观察到相邻基质中淋巴细胞积累的减少。总的来说，免疫空间位置变异性阐明了肿瘤生态学中的限制因素，这些因素可能会影响免疫逃避的亚克隆和侵袭性临床表型的出现。
据了解，分子分析方面的显著进展提高人们对癌细胞免疫逃逸进化的理解。然而，尚未阐明免疫和基质细胞的空间构象，这可能揭示免疫逃逸在肿瘤空间位置的进化。
文章来源：https://www.nature.com/articles/s41591-020-0900-x
作者：科学网 小柯机器人
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