搜寻我们肠道里的病毒
来源：中检健康
编辑：中检健康
时间：2020-09-23
肠道里并非只有菌群。所谓“肠道微生物群落”（gut microbiome），自然也会包括肠道中的病毒群落（virome）。但至今为止，肠道中的病毒仍未引起较高的关注。这一部分是由于病毒十分难找：与拥有固定标志（例如S16蛋白）的细菌不一样，病毒不具有固定标志，也因此不能像找寻肠道菌群那样来搜寻病毒。
Gregory等人另辟蹊径，利用了机器学习算法，将已知的病毒数据作为训练样本，使算法能帮他们搜寻肠道里不同种类的病毒。他们的分析显示，肠道病毒群落中，占比最大（97.7%）的是针对细菌的噬菌体（phages），其次才是真核细胞病毒和古菌病毒。他们还在真核细胞病毒中发现了一些植物病毒，并表示这很可能只是在肠道里短暂停留的、由食用植物带入的病毒。
Gregory等人另辟蹊径，利用了机器学习算法，将已知的病毒数据作为训练样本，使算法能帮他们搜寻肠道里不同种类的病毒。他们的分析显示，肠道病毒群落中，占比最大（97.7%）的是针对细菌的噬菌体（phages），其次才是真核细胞病毒和古菌病毒。他们还在真核细胞病毒中发现了一些植物病毒，并表示这很可能只是在肠道里短暂停留的、由食用植物带入的病毒。
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他们还发现，肠道病毒群落中的病毒种类十分因人而异，没有一种病毒在全部分析个体的肠道中出现。但一个普遍的规则就是，肠道病毒群体的多样性，从出生开始逐渐增加，直到65岁达到最高点，之后便逐渐下降。Gregory说：“一条黄金准则就是，一个生态系统中的多样性越高，这个系统就越健康。我们观察到，更健康的个体（的确）更大概率有更高的病毒群体多样性，这说明这些病毒也许（对我们）有益。”
参考文献：The Gut Virome Database Reveals Age-Dependent Patterns of Virome Diversity in the Human Gut.
文章来源：神经现实
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